| 21世纪是生命科学和信息技术的世纪，生物信息学作为跨越和融合世界科技中两个最活跃领域的一门新兴前沿学科，为生物学、物理、数学、计算机等专业的高素质人才提供了更广阔的发展天地。
作为我所/中心的核心部门之一的生物信息室，主要从事数据处理、软件开发、数据库建立与维护、项目研发、大型机管理、系统与网络维护等方面工作。其中数据处理和项目研发以计算机为工具，结合生物、数学、物理等多学科知识，对测序产生的原始数据进行处理和分析，获得传统生物学实验工作无法得到的结果。现阶段硬件指标为：计算量：286个CPU，721G
memory；速度：1.1亿万次/秒；储存数据：75T，每天产出30个G的基因组原始数据。生物信息室生物信息学平台是基因组学、蛋白组学、药物筛选的核心技术支撑及发展的灵魂，故三大平台的建设与生物信息学密不可分。
人员情况
生物信息室现有员工近百人，平均年龄25岁，具有本科及本科以上学历的员工超过全体的90％，其中生物专业约占31%、计算机专业约占33%、数理专业约占23%，其他专业占13%。国际一流的学术管理精英加上指导有方的中坚骨干和训练有素"工蜂"队伍组成了一支复合型、多元化、高素质的科研队伍。
不仅如此，生物信息室重视员工再教育，坚持办学与再教育相结合，积极培养人才，提高员工素质，仅2001年就与中科院、北大、浙大联合招收本科生100余人，硕士、博士研究生100余人，此外还有博士后及国内外客座研究人员10多人。人才的培养奠定了长期可持续发展的重要基础。
 学术实力
我所/中心顾问：Eric Lander
学术委员会成员：
杨焕明 所长；中国HGP执行小组长；国家自然基金委人类基因组重大项目秘书长。
于军 副所长；中国HGP成员；中科院百人计划成员。
郝柏林 中国科学院院士；研究生培养基地负责人；首席科学家（杭州）。
李松岗 教授，首席科学家（北京）。
Gane KS Wong 中心教授。
李国杰 中国工程院院士；中国科学院计算所所长。
陈润生 研究员，顾问专家。
郑伟谋 研究员，顾问专家。
李国英 研究员，顾问专家。
王文 研究员，顾问专家。
硬件设备
在生物信息室负担大型运算工作的是几部高性能计算机，分别包括：
1999年进入中心的SGI（十亿次 / 秒）,8G存储量；
2000年进入中心的曙光2000（百亿次 / 秒），1T存储量，该计算机在人类基因组计划中立下了汗马功劳；
2001年进入中心的曙光3000（千亿次 / 秒），3T存储量；
2001年7月进入中心的SUN10000超级服务器（千亿次 / 秒），10T存储量；
2002年进入中心的IBM690（七千亿次/秒），30 T存储量；
2002年进入中心的SGI Origin 3800服务器（五百亿次/秒），1 T存储量。
在海量数据的处理和分析过程中，要求这些高性能计算机的支持，因此生物信息室生物信息学平台的发展推动了国内外硬件设备的发展。此外，生物信息室提供的网络支持实现了数据共享、生物数据的网络化。
平台优势
软件系统：BLC与其他各软件的完美组合组成了功能强大、使用方便的软件系统；
数据库系统：
公用数据库：GENBANK、EMBL、SWISS-PROT、PIR、dbSNP、HGBase
自产数据库：
核苷酸序列一级数据库： 1％HGP、嗜热菌、杂交水稻、家猪、家蚕、鸡、大豆…
无冗余核苷酸序列数据库： HGP、嗜热菌、杂交水稻、家猪…
核苷酸序列二级数据库： 基因、Exon/Intron、SNP(炎黄一号)、EST、REPEATS、CDNA、芯片
蛋白序列数据库： 1％HGP、嗜热菌…
蛋白结构数据库： 1％HGP、嗜热菌…
计算生物学：
进行数学、统计学方面的研究(HMM等)，郝柏林、郑伟谋、李国英。
高性能计算：
曙光2000一台，曙光3000两台，SUN10000超级服务器一台，IBM P690两台，SGI超级服务器两台。具备了国内领先的强大运算能力。
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